La UPMARENA promueve la inclusión de conceptos ecológicos, tales como manejo integrado de plagas, empleo racional de fertilizantes y uso eficiente del agua de riego en la agricultura convencional para mejorar los agroecosistemas y garantizar su sostenibilidad.

Fomenta la investigación aplicada para mejorar las técnicas de producción, como la rotación de cultivos, policultivos, abonos verdes y practices de control biológico que consolidan la agricultura ecológica certificada. Apoyará tecnologías que propicien un mejor funcionamiento de los sistemas agroforestales y silvopastoriles.

También auspiciará los programas nacionales de manejo de cuencas hidrográficas, de desarrollo ecoturístico y biodiversidad, así como el desarrollo de los servicios ambientales.