La Ley No. 498-06 de Planificación e Inversión Pública y su Reglamento de Aplicación No. 1, establecen la obligatoriedad de que todas las instituciones públicas centralizadas y descentralizadas dispongan de una unidad de Planificación y Desarrollo e igualmente se señalan las funciones que deben desarrollar.

El CONIAF, en cumplimiento de esta ley incluye en su organigrama la División de Planificación y Desarrollo y dichas funciones son:

1. Coordinar la elaboración de los Planes Estratégicos Institucionales, acorde con el Plan Estratégico del Sector Agropecuario.

2. Coordinar la elaboración del Plan de Inversión Pública de acuerdo con el Plan Estratégico Institucional.

3. Participar conjuntamente con la División Administrativa y Financiera, en la formulación del presupuesto institucional, en los aspectos referidos a la instrumentación del plan estratégico institucional, así como en la definición de la estructura programática del presupuesto.

4. Evaluar el impacto de los Planes Estratégicos Institucionales.

5. Revisar y proponer la actualización de la estructura organizativa y de procesos relativos al desarrollo interno de la institución.

6. Coordinar la organización y ejecución de las Convocatorias Públicas para la presentación de propuestas de investigaciones agropecuarias y forestales.

7. Apoyar a las áreas sustantivas en el seguimiento a los proyectos de investigación.

8. Coordinar la elaboración y puesta en marcha de los programas de formación de recursos humanos.

9. Elaborar las memorias anuales institucionales.

10. Coordinar la elaboración de los planes operativos acorde con el Plan Estratégico Institucional.

11. Coordinar las discusiones para la aprobación de solicitudes de apoyo financiero de otras instituciones.

12. Apoyar la gestión del Comité Técnico

13. Apoyar al Director Ejecutivo en la gestión del Pleno del Consejo.

14. Coordinar la organización de eventos para la publicación y difusión de los resultados de las investigaciones.

15. Atender las solicitudes de informaciones de las demás unidades organizacionales de la Dirección Ejecutiva.

Atender cualquier otro asunto en el marco institucional que le sea confiado por el Director Ejecutivo.