El proceso de innovación y difusión tecnológica debe apoyarse en la formación de los recursos humanos requeridos para producir la necesaria especialización en los diferentes contextos del saber.

El CONIAF, consciente de esto dispone de un fondo para la Formación de Recursos Humanos. A través de acuerdos de trabajo, suscritos con el Centro para el Desarrollo Agropecuario y Forestal (CEDAF) se desarrollo un programa dirigido a formar una masa crítica de profesionales con capacidad para generar, validar, adoptar y transferir los conocimientos adquiridos a los productores agropecuarios y forestales, tomando en cuenta la protección del medio ambiente y los recursos naturales.

En tal virtud, ha contribuido a la formación de 165 profesionales (150 en el país y 15 en el exterior).
En este programa de Formación de Recursos Humanos, se incluyen seis programas de maestría, ejecutados con cuatro (4) universidades locales. Los programas de maestría en Manejo Integrado de Plagas, Manejo y Conservación de Suelos Tropicales ejecutados en la Universidad Autónoma de Santo Domingo (UASD); el programa de Maestría en Ecología y Medio Ambiente con la Universidad Nacional Pedro Henríquez Ureña (UNPHU); el programa de Maestría en Economía Aplicada, mención Economía Agrícola, en la Pontificia Universidad Católica Madre y Maestra y los programas de maestría en Biotecnología, Epidemiología Veterinaria y Protección Vegetal en el Instituto Superior de Agricultura (ISA).

Asimismo el CONIAF, dentro del convenio SEA/CONIAF-CATIE-CEDAF ha apoyado la participación en programas de maestría y cursos especializados en el Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza (CATIE), Costa Rica, de profesionales en diferentes áreas, tales como Agro negocios, Agricultura Ecológica, Manejo de Cuencas Hidrográficas, Extensión Agrícola ; Mecanismo de Desarrollo Limpio (MDL), y otras. También se ha apoyado la realización de maestrías en suelos, y protección vegetal en la Universidad de Puerto Rico. En adición el CONIAF ha auspiciado la participación de investigadores en eventos científicos internacionales.

Estos programas fueron creados con el objetivo de lograr que el país disponga de una masa crítica de profesionales capaces de impulsar, desarrollar y validar las tecnologías necesarias que requiere la agropecuaria del país.